Bienvenue dans les rues de New York, où règnent le chaos humains-mutants et la meilleure pizza. C'est aux frères Tortues de ramener la paix dans Tortues Ninja : Les Mutants se Déchaînent !

De nouveaux mutants (ou comme les Tortues les ont appelés les Muveaux) ont bien travaillé pour être acceptés par les citoyens. Mais tout a changé quand certains mutants ont commencé à semer le chaos. Des égouts aux gratte-ciels, aucun lieu n'est à l'abri du désordre qui se répand en ville. Cela sent le TCRI à plein nez. Maintenant, c'est aux quatre intrépides de laisser libre cours à leurs compétences ninja uniques et d'arrêter cette folie avant que les relations humains-mutants auxquelles ils ont tant travaillé ne soient détruites. Utilise l'adrénaline dans tes veines pour sauver la ville et demander l'aide d'April et de Splinter.